1960年5月，刘少奇等从重庆乘轮东下，查勘长江三峡，并对三斗坪坝线和中堡岛的勘探钻井实地视察。
1960年，当三峡工程开工在即之时，内忧外患同时向中国包围而来，严重的自然灾害和苏联的背信弃义，不得不使中国人重新考虑一切。三峡工程同样成为被重新审视的对象。8月，在党中央北戴河会议上，原准备在60年代初期开始兴建三峡工程的建设步伐被正式调整放慢。同时，周恩来指示：“雄心不变，加强科研，加强人防。”
20世纪60年代中后期，风雨如磐的中国，从1966～1968年，三峡工程前期工作处于停顿状态。
三、兴建葛洲坝水利枢纽工程
1969年底，出于对荆江防洪和缓和华中用电紧张等问题的考虑，有关方面又提出兴建三峡工程的问题。但由于当时处于战备时期，党中央和毛泽东对此建议未予考虑。在特定的历史条件下，葛洲坝工程问题却被提上议事日程。
进入70年代，随着毛泽东作出“赞成兴建此坝”的批示，葛洲坝于1970年12月30日正式动工。中共中央在对葛洲坝工程的批示中指出：“修建葛洲坝水利枢纽，是有计划、有步骤地实现伟大领袖毛主席‘高峡出平湖’的伟大理想的实战准备”。
1972年11月，周恩来在听取葛洲坝工程汇报时说：葛洲坝工程是三峡工程的实战准备，“……现在建葛洲坝，要成为三峡大坝的试验坝”。
四、三峡工程的重新论证
1975年，国家建设委员会决定召开三峡水利枢纽工作会议，研究坝址选择、水库水位问题。
1975年5月，长江三峡水利枢纽选坝会议在武汉举行。会后，水利部向国务院建议按“三斗坪坝址开展初步设计工作”。
1980年，邓小平从重庆乘轮东下，视察三峡坝址、葛洲坝工地、荆江大堤防洪形势，听取汇报，召集有关领导同志研究三峡问题。8月，国务院常务会议研究了三峡问题，决定“关于三峡建设问题，由科委、建委负责，继续组织水利、电力及其他方面的专家进行论证，提出意见”。
1982年，随着葛洲坝工程进展顺利，中央领导同志指示，三峡水利枢纽工程拟列入近期国家计划。
1983年，国家科委在北京召开会议，对三峡低坝方案（蓄水位150米）需要论证的重大技术经济问题与各部门交换意见。国务院要求川、鄂两省对库区基本情况进行全面调查复核。
1984年2月，国务院和中央财政经济领导小组会议讨论水电部《建议立即着手兴建三峡工程的报告》，决定开始施工准备，争取1986年正式开工。这是国务院继1958年后第二次批准三峡工程。
1985年5月，国务院三峡工程筹备领导小组召开扩大会议，组织对三峡工程正常蓄水位的进一步论证。
1986年4月，中央领导同志前往三峡库区和坝址视察。6月，经过反复研究后，中共中央、国务院联合发出了《关于三峡工程论证工作有关问题的通知》，通知要求水利电力部“广泛组织各方面的专家”，“在广泛征求意见，深入研究论证的基础上，重新提出三峡工程的可行性报告”。并决定“成立国务院三峡工程审查委员会，负责审查水利电力部提出的三峡工程可行性报告，提请中央和国务院批准，最后提交全国人民代表大会审议”。
1990年7月，国务院召开三峡工程论证汇报会，国务院三峡工程审查委员会对新编的三峡工程可行性报告进行审查。
1991年8月，审查委员会完成了审查工作，通过了可行性研究报告，报国务院正式审批后，提请全国人大审议。