生产上栽培的各种果树、蔬菜和观赏植物，都是从野生植物中选择出来经人工驯化而成的，习性各异，种类繁多。只有对园艺植物进行科学的分类，才能进一步深入系统地研究其栽培管理等其他问题。通常的园艺植物分类方法有植物学分类和园艺学分类两种。
植物学分类是按照植物自然进化系统，按门、纲、目、科、属、种和变种进行分类。全世界的植物有40多万种，归属于300多个科，绝大部分科中有园艺植物。中国果树有670余种，分59科，主要科别有：蔷蔽科、芸香科、葡萄科、鼠李科和无患子科等。蔬菜有220多种，分66科，主要科别有：十字花科、豆科、百合科、茄科、葫芦科、菊科、藜科和伞形科等。观赏植物包括范围更广，仅温带观赏植物就有8000余种（包括变种），主要科别有：松科、柏科、木兰科、莲科、仙人掌科、牡丹科、山茶科、杜鹃科、蔷薇科、报春花科、木樨科、械树科、忍冬科、菊科、百合科、鸢尾科和兰科等。
园艺学分类是根据园艺植物的生物学性状和栽培技术特点进行分类，又称为农业生物学分类，是园艺学上最常用的分类方法。根据园艺学分类法首先将园艺植物按其实用价值分为果树、蔬菜和观赏植物三大类，广义地还包括药用和芳香植物类。但是，有些园艺植物能满足人们的多种需要，很难说它只属于某一类园艺植物，需要依其栽培目的而定。例如荷，其地下茎可作蔬菜，花与叶用于观赏，种子既是果品又可入药。
现根据园艺学分类法，将果树、蔬菜和观赏植物三大类园艺植物的分类分述如下：
（一）果树的分类
1．落叶果树
（1）仁果类 苹果、梨、山植、木瓜等。
（2）核果类 桃、梅、李、杏、樱桃等。
（3）坚果类 核桃、山核桃、栗、榛、阿月浑子、银杏、扁桃等。
（4）浆果类 树莓、醋栗、无花果、石榴、葡萄、猕猴桃、草莓等。
（5）柿枣类 柿、枣、酸枣、君迁子等。
2．常绿果树（1）柑果类 柑橘、甜橙、酸橙、柠檬、柚、葡萄柚、金柑、枳、黄皮等。
（2）浆果类 杨桃、蒲桃、连雾、番木瓜、人心果、番石榴、枇杷等。
（3）荔枝类 荔枝、龙眼、韶子等。
（4）核果类 橄榄、油橄榄、杨梅、油梨、枣椰等。
（5）坚果类 腰果、椰子、槟榔、澳洲坚果、香榧、山竹子、榴连等。
（6）荚果类 酸豆、角豆树、四棱豆、苹婆等。
（7）聚复果类 树菠萝、面包果、番荔枝、刺番荔枝等。
（8）草木类 香蕉、菠萝等。
（9）藤木类 西番莲、南胡颓子等。
（二）蔬菜的分类
1．根菜类
包括萝卜、胡萝卜、芜菁、辣根、美洲防风、牛蒡等。
2．白菜类
包括白菜、芥菜、甘蓝等。
3．茄果类
包括番茄、茄子、辣椒等。
4．瓜类
包括黄瓜、西瓜、南瓜、西葫芦、甜瓜、冬瓜、丝瓜、佛手瓜、苦瓜等。
5．豆类
包括菜豆、豇豆、毛豆、扁豆、豌豆、蚕豆等。
6．葱蒜类
包括洋葱、大葱、大蒜、韭菜等。
7．薯芋类
包括马铃薯、姜、芋、山药等。
8．绿叶蔬菜类
包括芹菜、莴苣、菠菜、苋莱、蕹菜等。
9．水生蔬菜类
包括莲藕、茭白、慈姑、荸荠、菱、水芹菜等。
10．多年生蔬菜类
包括竹笋、金针菜、芦笋、百合、香椿等。
11．食用菌类
包括蘑菇、草菇、香菇、木耳、银耳等。
（三）观赏植物的分类
1．露地花卉
（1）一年生花卉 凤仙花、鸡冠花、一串红、半支莲、千日红等。
（2）二年生花卉 雏菊、三色堇、花棱草、金鱼草、虞美人、石竹、紫罗兰等。
（3）宿根花卉 菊花、芍药、蜀葵、萱草、铃兰等。
（4）球根花卉 唐富蒲、小苍兰、水仙、郁金香、自芨、美人蕉、大丽花、花毛茛等。
（5）水生花卉 荷花、睡莲、凤眼莲等。
2．温室花卉
（1）一、二年生花卉 瓜叶菊、蒲色花、彩叶草、香豌豆等。
（2）宿根花卉 报春花、铁线蕨、非洲菊、君子兰等。
（3）球根花卉 仙客来、朱顶红、马蹄莲、大岩桐等。
（4）多浆植物 仙人掌、昙花、蟹爪兰、景天、龟甲球等。
（5）兰科植物 春兰、惠兰、建兰、墨兰、石斛、兜兰等。
（6）凤梨科植物 水塔花、筒凤梨等。
（7）棕榈科植物 蒲葵、棕竹、椰子等。
（8）水生花卉 王莲、热带睡莲等。
（9）温室花木 一品红、变叶木、山茶、米兰、三角花、玉兰等。
3．木本花卉
（1）常绿乔木 桂花、广玉兰等。
（2）落叶乔木 梅花、白玉兰等。
（3）常绿灌木 金丝桃、夹竹桃等。
（4）落叶灌木 腊梅、牡丹、月季等。
（5）藤本植物 紫藤、凌霄等。
4．观赏树木
（1）常绿乔木 香樟、棕榈、柳杉、雪松、刺柏等。
（2）落叶乔木 乌桕、梧桐、槭树、悬铃木等。
（3）常绿灌木 南天竹、大叶黄杨等。
（4）落叶灌木 山麻杆等。
（5）藤本植物 薛荔、常青藤等。
5．草坪植物
（1）暖地型草坪草 结缕草、狗牙根、画眉草、地毯草、假俭草、钝叶草等。
（2）寒地型草坪草 小糠草、六月禾、早熟禾、羊茅、黑麦草、雀麦、硷茅、冰草等。