扎陵湖中有三个小岛，岛上嶙峋的岩石，成为天然鸟巢，栖息着大雁、棕颈鸥、鱼鸥、赤麻鸭、鹭丝等20多种候鸟。鸟群每年5月飞来，筑巢垒窝，繁衍生息，湖之上空整天一片嘎嘎之声。6月，岛上遍地鸟蛋，几乎无处下脚。鸟群中的天鹅和黑颈鹤是国家重点保护动物，尤其是黑颈鹤更是我国特有的珍贵鸟种。鄂陵湖南部也有三个小岛，岛上居住着白唇鹿群，它的茸产量高，是鹿茸中的新品种。这种珍贵的野生动物已在岛上驯养成功，游人可观赏它们可爱的憨态。
扎陵湖和鄂陵湖有着丰富的鱼类资源。湖中大都是冷水性无鳞鱼，以花斑裸鲤、扁咽齿鱼、黄河裸鲤、骨唇黄河鱼、三眼鱼等为主。过去当地的藏族牧民有敬鱼为神的习俗，不捕不吃，鱼类自然繁殖，湖中的鱼多不胜数。如今，扎陵湖和鄂凌湖的渔业资源开发迅速，每年捕捞达几百万斤。
在扎陵湖的西南方向，有两座大山遥遥相望。一座叫“恩片卓玛”，意思是披着白纱的女神；另一座叫“琼走”。高耸的山顶上白雪皑皑，湖岸上是如茵的草原，大自然的神笔在此描绘出一幅风光绮丽的图画。恩片卓玛婀娜多姿，峰峰玉立，琼走则稳重端庄。清乾隆四十七年（公元1782年），因河南省境内的一段黄河泛滥成灾，清政府曾遣乾清门侍卫阿弥达到这里来“穷河源，祭河神”，祈祷上天。现在来这里放牧的藏胞，还经常在山脚下垒起玛尼石，刻上经文，祈求神灵保佑人畜平安。
两湖之间的措尔杂则山，传说中是藏族民族英雄格萨尔土最宠爱的土妃珠牡的化身。站在山上，周围的湖光山色尽收眼底，两湖的形状也清晰可见。扎陵湖的形状如倒置的梨，而鄂陵湖则像座金钟。据科学工作者最新实测，扎陵湖面积为526平方公里，平均水深8．9米；鄂陵湖面积610．7平方公里，平均水深17．6米。