二、水运
市境水网发达，径流丰富，河水终年不冻，通航河流有16条，形成了以长江为骨干，嘉陵江、乌江等干支流为主体，构成了一个天然的运输网，是我国内河航运发达的地区之一。
（一）主要航道
1．长江
长江航运是全市水上运输的大动脉，同时也是西南地区出入三峡的一条大动脉。三峡段为峡谷区，江窄流急，滩礁星列，不利航行。此外，每年10至翌年4月为河段雾季，尤其在冬季浓雾更甚，船舶经常受阻（扎雾）。自1949年以来，对长江河道不断进行整治，并实现航标电气化，昼夜通航，现重庆—宜昌间终年可通航1500吨级客货轮。
长江不仅和市境内主要支流航线相通，而且联系几条主要铁路干线，并与众多公路成纵横交错状。长江对缓解重庆市运输紧张的压力，促进与长江中下游地区的物资交流，繁荣西南地区的经济，均有特别重要的作用。
长江流经市境688千米，水运资源很丰富，同时三峡旅游线又是一条重要的旅游线路，三峡成库后，长江重庆段水运条件将大大改善，利用水运优势，发展水上运输是大有可为的。但是，在发展长江水运时，我们要注意处理好时间差和解决好水位差的问题。
2．嘉陵江
嘉陵江是沟通重庆市与四川省之间南北水陆联运的一条主要水运干线，重庆—广元终年能通航机动船。
3．乌江
乌江以滩多水急而闻名，号称“天险”。乌江在重庆市境长188千米。经过长期整治，改善了通航条件，涪陵——思南段终年通航客货轮。
乌江是黔东北、渝东南山区联系长江的一条重要水运干线，对重庆、贵州两省市的经济发展和物资交流都有很大的促进作用。[NextPage]
（二）主要港口
1．重庆港
重庆位于长江、嘉陵江汇合处，为长江上游最大的港口，历来是西南地区的重要水上门户。从1980年起，重庆可直接办理进出口业务，因而它又是西南地区唯一的对外贸易口岸。重庆为水陆运输枢纽，公路铁路、公路和水运的旅客换乘和物资换装工作都在重庆港进行，客货运输十分繁忙，经济联系非常广泛。进出港口的主要物资有机械设备、轻工产品、矿石、煤炭、粮食、盐、化肥、石油、日用品、食品及农副产品等。
三峡工程建成后，重庆港将成为“江阔水深，通江达海”的港口。
2．万州港
万州港是重庆东部水陆交通枢纽，长江上游重要的港口之一，长江三峡的门户和长江三峡风景名胜区旅游服务基地。进出港口的主要物资有煤炭、石油、钢铁、矿建材料、粮食、轻工产品、化肥、日用品、药材、盐、土特产品等。
万州是以盐化工为主导工业的沿江开放城市。
2．涪陵港
涪陵港地处长江与乌江汇合处，是乌江进出物资的集散地，为长江沿岸的重要港口之一。进出港口的主要物资有煤炭、石油、化肥、药品、榨菜、日用品、粮食、建材、轻工产品、盐等。
涪陵是以发展食品、轻纺、机械为主的沿江开放城市。
4．合川港
合川港位于重庆北部嘉陵江边，是渝北水电生产基地之一和水陆交通枢纽。进出港口的主要物资有粮食、煤炭、盐、建材、化肥、日用品、农副产品等。
此外，还有长寿港、江津港等。