合理开发利用环境资源，使可更新资源能永续利用；不可更新资源节约和合理利用；工业布局要合理，寻求最佳的土地利用方案等，都是环境保护工作的重要内容。如何运用经济手段，促使经济管理工作者、企业的领导人在发展生产的过程中，愿意为保护和合理利用资源作出贡献，是环境经济、环境管理研究的重要内容。
1．征收水资源费，促进节约、合理用水
水是宝贵的不可替代的资源，水资源紧缺已成为世界性的问题。我国有300个城市缺水，有50多个城市严重缺水，所以，应该坚持水资源有偿使用，收取水资源费（不是供水部门通常收的“水费”），促进节约、合理用水。
当前大多数城市水资源费偏低，每吨水资源只收0.05～0.1元。所以用水单位不肯为增加节水设施投资，不重视通过技术改造压缩生产工艺的用水量，提高重复用水、循环用水率。北方城市大多数都过量开采地下水，超过了地下水的“可恢复储量”。这样做的结果，地下水的水位就会逐年下降，甚至枯竭，并可能造成地面沉降。地下水有不同的含水层，补给关系也比较复杂。对地下水的使用必须统一规划。
对企业使用地下水要按地区的特点规定打井深度。根据其生产规模和工艺条件规定抽用地下水的定额。超额用水要加重收水资源费，并实行累进制，即超过某一限额收费额按一定的比例递增。常期超额使用地下水，超过一定的时限（1～2年），收费额也按一定的比例递增。总之，要用经济手段迫使企业在规定限额之内抽取地下水，水资源费急待提高。
2．征收资源税，保证煤炭等矿产资源合理开采使用
在煤炭等矿产资源丰富的地区，应该“有水快流”，尽快地开采使用，促进社会主义现代化建设。但是，社队小煤窑回采率低（15％～20％），开采方法比较落后；国家的统配矿回采率高（80％～85％），生产设备和工艺先进。当前的矛盾主要是，国家统配矿和地方矿无力把应开采的煤炭等矿产尽快开采出来，开采量满足不了国家经济建设的要求。所以，应该允许和支持广大群众发展小煤窑。但由于小煤窑回采率低，如果在储量大的矿区发展了小煤窑，只回采了15％～20％，大部留在地下，而国家统配矿也无法再开采了，从资源合理开发利用、综合经济效益分析来看，是不合算的。所以，要统一规划，划定开采区的类型，并用征收资源税的办法保证规划的实施。比如，储量大、煤层连片的矿区可以多征资源税，只有回采率在80％以上的才有明显的经济效益。而煤层不连片，或大矿的边缘，适于发展小煤窑的地区，则不收资源税，或收的很少，使回采率低的小煤矿也能有经济效益，利用经济手段使大、小煤矿合理布局。
五、环境成本核算
在传统的经济学中，环境向来被视为非经济因素。环境为经济发展所付出的代价，在漫长的发展过程中，几乎从来没有被纳入成本核算。但是，从环境经济学外部不经济性的理论来分析，这实质上是私人成本（或企业成本）社会化。
例如：我国某省一个中型造纸厂，年利税1700万元，但该厂所排废水及所含污染物给下游某城市造成的污染损失达3500万元。这说明该造纸厂对下游的某城市存在着外部不经济性。按照“污染者付费”的原则，该造纸厂是将应付的污染治理费转嫁给了下游城市，将应计入成本的环境代价转嫁给了社会，这样做不符合可持续发展的要求。
《中国21世纪议程》在第2章和第4章中明确指出：“控制污染，改善生态环境，保护可持续利用的资源基础”；“将环境成本纳入各项经济分析和决策过程，改变过去无偿使用环境并将环境成本转嫁给社会的作法”。根据上述指导原则，企业应该进行环境成本核算，使进入市场的产品价格能准确地反映生产经营活动中所造成的全部环境代价。企业为了降低成本、提高市场竞争力，就必然会尽力降低生产经营活动过程中所造成的环境代价。