观测地点的选定
物候观测点的选择一定要有长远性、代表性，并要考虑能方便工作的原则。一个地方的观测资料，其年代越长越有价值，所以观测点要固定，选定的点要能进行多年观测，不应轻易变动；所选的观测点还要能代表那个地方的地形、土壤、植被情况，尽可能是在平坦开阔的地方；为了工作方便，观测点还须选在观测员住地附近，或是上下班经过的地方，对业余观测者来说，则可达到工作观测两不误。观测点选定以后，务必将地名、生态环境、海拔高度、地形、位置、土壤状况等详细地记录下来，长期保存，以备必要时查考。
观测种类和目标的选定
在一个地方进行物候观测，不能漫无目的什么都观测，也不能有什么就观测什么，而是要选择那些最能反映当地季节早晚，以及与农业生产关系密切的物候现象。应按以下三个原则确定观测种类和项目：
（1）选择常见的、自然生长的植物、动物，各地按统一的方法同时进行观测。
观测的动植物中，有一部分是作为季节和农时指示物的，也叫指标植物。指标植物不论是木本的或草本的，都应尽可能选用野生的；如是人工栽培的，但须是不经常施肥浇水的植株。这是因为在人工管理下，植物发育速度会加快，不能准确地反映当地的气候变化。例如，同一年里，一些在城市公园里精心管理下的美人蕉，比郊区农民宅前无专门管理的植株，始花要早十多天。使用盆栽植株则更不适宜。植物有光周期现象，如在诱蛾灯下的水稻贪青，成熟期较晚，所以观测植物不应选路灯下的。
（2）所选指标植物种类的多少，应结合观测目的和任务来全面考虑。指标植物的形态和变化，必须容易识别，同名异种，同种异名的，必须分辨清楚。
为了编制自然历，应有相对多的植物种类，使每一、二候至少有一种物候现象。物候历中所包含的物候现象愈多，自然物候季节的划分则愈细，在一个季节中用来指示气候变化的物候指标也愈多，那么季节和农时的预报则愈可靠；为了研究区域气候变化规律，要尽量选用分布广的植物种作为观测对象，因为广布种愈多，不同地方有相同指标植物的机会也愈多，相互参考的作用愈高，对绘制区域性物候图便有利。
还必须严格鉴别观测植物的种类。对于业余观测者来说，这是容易被忽略的。在一些物候书上，有关的动植物名称都注有拉丁文学名，这就是为了区别种类。日常生活中，植物同名异物的现象是很多的。如叫酸枣的有两种：北方的酸枣是鼠李科枣属植物，为灌木或小灌木，果可食，果仁可入药；而在长江流域及其以南地区产的一种酸枣，是属于漆树科的，为大乔木，果实亦可食，果形和味道均似北方酸枣，但两者是不同的东西。又如木瓜，广东的水果番木瓜也叫木瓜，属番瓜树科；另外蔷薇科有一种中药叫木瓜；在北京昌平地区，习惯把文冠果（一种油料植物）叫做木瓜，文冠果为无患子科植物，只不过其果实有点象蔷薇科的木瓜而已。植物同物异名的情况也很普遍。如国家气象局规定作物候观测的益母草（也是中草药），在东北叫坤草或益母蒿，江苏叫野麻或田芝麻，浙江叫三角胡麻，四川叫青蒿，福建叫野故草，广东叫红花艾，广西叫益母菜，青海叫千层塔，云南叫透骨草，可谓五花八门。所以确定作为观测对象的植物，都必须请植物学行家鉴定学名，这是一项影响深远的基础性工作。
（3）根据应用对象确定观测植物种类。为研究气候变化，要进行古今物候对比，为了引种要进行中外物候对比，所以古代已有物候记载的种类，如杏，桃等要列为观测对象；世界多数国家进行观测的植物，如紫丁香、刺槐等也应选入；如是为了养蜂则主要选蜜源植物；如是为了牧场管理，则主要选牧草，等等。
根据以上原则，我国的全国物候观测组织，指定了若干种动、植物，农作物，以及水文气象现象作为共同观测项目。