（5）保护渔业资源。我国重视近海渔业资源的保护工作，先后建立了各种禁渔区、禁渔期、保护区，实行伏季休渔、限制幼鱼比例等制度，取得了良好的效果。自1995年起，在东海和黄海实行新的伏季休渔制度，即在北纬26°～35°的黄海和东海渔区，每年6月1日～9月15日，禁止所有拖网和帆船张网作业；北纬35°以北的黄海渔区，每年7月1日～8月31日，禁止所有拖网和帆船张网作业；北纬24°30′～26°海域，也休渔两个月，具体时间由福建省政府决定。在黄海中部设立了对虾亲虾休渔区，比较好地保护了对虾资源。在休渔期间，做到“船靠港、网入库、人上岸”。1997年我国政府制定了控制海洋捕捞强度指标的政策，其中最重要的是加强对渔船数量和功率的控制，要求将其控制在1995年以前的水平；同时，严格限制拖网和定置网作业，压缩帆船张网规模。
休渔制度已经取得了很好的经济效益、社会效益和生态效益。休渔期间，带鱼、黄鱼、鲳鱼等幼鱼资源得到保护，近海渔业资源得到休养生息，资源量明显增加。据统计，1997年与1994年比较，带鱼增长15%，小黄鱼增长37%，鲳鱼增长113%，鲐鱼增长17%。
我国积极参与了公海渔业资源的保护管理工作。从90年代初开始，我国先后参加了一系列公海渔业资源养护和管理公约，参加保护渔业资源的国际合作。1993～1995年，我国参与了联合国《关于养护和管理跨界和高度洄游鱼类种群协定》的制定工作。先后与俄罗斯、美国、日本等国就开发和保护白令海渔业资源问题进行谈判，并签署了《中白令海峡鳕资源养护和管理公约》。为了保护公海渔业资源，我国参与了保护金枪鱼、鲸类，以及濒危物种的国际活动，并参加了《促进公海上渔船遵守国际养护和管理措施的协定》的制定工作。
（6）海洋自然保护区建设。1995年我国政府有关部门制定的《海洋自然保护区管理办法》，贯彻“养护为主、适度开发、持续发展”的方针，把各类海洋自然保护区划分为核心区、缓冲区、实验区，科学合理地进行海洋自然保护区的建设和管理。到2000年，我国已建海洋类型自然保护区59个，总面积1.29万平方千米，其中包括海湾保护区、海岛保护区、河口海岸保护区、珊瑚礁保护区、红树林保护区、海岸泻湖保护区、海洋自然历史遗址保护区、湿地保护区等。