在漫长历史时期内，青海湖的鱼类资源几乎不为人们所利用。新中国成立后，青海湖的渔业生产才获得发展，建立了国营渔场，采用机动船只捕捞，年产量一般在4 000吨上下。青海湖现已成为西北地区重要的水产基地。
湖中还有沙岛、海心山、海西山、鸟岛和三块石等5座岛屿。各岛面积悬殊，形态各异，但岛上都栖息着众多的候鸟。其中尤以海西山和鸟岛，候鸟最为集中。每年5月下旬，那些栖息在东南亚、印度、巴基斯坦、尼泊尔等国家以及中国南方的斑头雁、鱼鸥、棕头鸥、鸬鹚。赤麻鸭等10多种鸟类陆续飞来，在岛上产卵孵雏。一眼望去密密麻麻的鸟巢，一个挨着一个，有白玉色、青绿色、棕色斑点的鸟蛋，比比皆是。据统计，在这不到0.6平方公里的小岛上栖息的鸟类就有10万只之多。为了使这些候鸟的栖息场所不致受到破坏，现在已将这两个小岛列为国家的重点自然保护区。