根据我国以预防为主的环境保护方针，为要防止土壤污染，首先要控制和消除土壤污染源。同时，对已经污染的土壤，要采取一切有效措施，清除土壤中的污染物，或控制土壤中污染物的迁移转化，使其不能进入食物链。
一、控制和消除土壤污染源
1．控制和消除工业“三废”的排放
大力推广闭路循环、无毒工艺，以减少或消除污染物质；对工业“三废”进行回收处理，化害为利。当前必须排放的“三废”，要进行净化处理，控制污染物排放的数量和浓度，使之符合排放标准。
利用污水灌溉和污泥时要经常了解污染物质的成分、含量及其动态，控制污水灌溉数量和污泥施用量，以免引起土壤污染。
2．控制化学农药的使用
对残留量高、毒性大的农药，应控制使用范围、使用量和次数。大力试制和发展高效、低毒、低残留的农药新品种，探索和推广生物防治作物病虫害的途径，尽可能减少有毒农药的使用。
对本身含有毒物质的化肥品种，施用范围和数量要严格控制。硝酸盐和磷酸盐肥料，要合理施肥、经济用肥，避免施用过多造成土壤污染。
二、增加土壤容量和提高土壤净化能力
增加土壤有机质和粘粒数量，可增加土壤对污染物的容量。分离培育新的微生物品种，改善微生物土壤环境条件，增加生物降解作用，是提高土壤净化能力的重要环节。
三、防治土壤污染的措施
1．利用植物吸收去除重金属
羊齿类铁角蕨属的植物，有较强吸收土壤重金属的能力，对土壤中镉的吸收率可达10％。连种多年，可降低土壤含镉量。
2．施加抑制剂
重金属轻度污染的土壤，施加某些抑制剂，可改变重金属污染物质在土壤中的迁移转化方向，促进某些有毒物质的移动、淋洗或转化为难溶物质，以减少作物吸收。一般施用的抑制剂有石灰、碱性磷酸盐等。如施用石灰，可提高土壤pH值，而使镉、铜、锌、汞等形成氢氧化物沉淀。
碱性磷酸盐可与土壤中的镉作用生成磷酸镉沉淀，特别在不能引起硫化镉沉淀的还原条件下，磷酸镉的形成对消除镉污染具有重要意义。
3．控制氧化还原条件
水稻土的氧化还原状况，可控制水稻土中重金属的迁移转化。据研究，淹水可明显地抑制水稻对镉的吸收，落干则促进镉的吸收。特别在水稻抽穗到乳熟期，无机成分大量向穗部转移，落干更将显著提高稻粒中镉的浓度。这主要是由于土壤氧化还原条件的变化引起镉的形态转化所致。除镉外，铜、铅、锌等元素也能与土壤中的H2S反应，产生硫化物沉淀。因此，加强水浆管理，控制氧化还原条件，可有效地减少重金属的危害。但砷则与其他重金属相反，随 Eh降低，可溶性和毒性增加。
4．改变耕作制
改变耕作制，改变土壤环境条件，可消除某些污染物的毒害。据我国苏北棉田旱改水试验，DDT和 666在棉田中的降解速度很缓慢，积累明显，残留量大。而棉田改水田后，可大大加速DDT的降解。
5．客土、深翻
被重金属或难分解的化学农药严重污染的土壤，在面积不大的情况下，可以采用客土法去除污染物。但是对换出的污染土壤必须妥善处理，防止次生污染。此外，也可将污染土壤深翻到下层，埋藏深度应据不同作物根系发育情况，以不致污染作物而定。