四是城乡居民收入水平差距越来越大。因缺各地区1980年城乡居民收入统计资料，无法进行对比。2004年，天山北坡地区城镇居民人均可支配收入各市县的平均值为8034元。而南疆三地州城镇居民人均可支配收入的平均值为6384元，仅相当于天山北坡地区的79％；尤其是农民人均纯收入差距十分突出，南疆三地州农民人均纯收入的平均值为1405元，天山北坡地区为4906元，是南疆三地州的3．5倍。两地区城乡居民收入差距比分别为4．54：1和1．63：1，南疆三地州比天山北坡高出2．9倍，恐怕是全国城乡居民收入差距最高、城乡二元结构最突出的地区。
二、原因
造成新疆区域经济不平衡的原因是多方面的，主要可归结为以下三方面的原因。
一是地理因素。新疆偏远山区的县与交通便利的县相比，经济上缺少往来和投资，必然会导致经济发展比较慢。广大山区由于交通闭塞，与外界的经济往来更少，需要的进不来，富余的出不去，使得穷者愈穷、富者愈富，如和田县。而对沿边县域来说，虽有发展边贸的区位优势，但由于劣势大于优势，致使优势难以很好发挥，外贸兴边作用还不明显，经济发展水平较低。石油资源丰富且已大规模开发的市县和位于交通枢纽和交通干线上的市县，经济发展相对较快。
二是科技方面的因素。新疆相当一部分县缺乏大量的科研投入和发展县域经济的人才，而大多数人才留在了经济比较发达的大中城市，这不利于高新技术的消化吸收和地区产业结构的调整优化，地区经济进一步发展的速度比较慢。这种状况若再持续下去，势必给新疆各县经济发展带来很大影响。
三是经济基础因素。新疆是一个经济后发的省区，各个县的基础不同，沿边县域的经济发展基础薄弱，距经济核心区远，资金、技术和人才等生产要素欠缺，使优势难以很好发挥，外向型经济的发展受到很大限制，外贸兴边、带动经济发展的实质性作用还不明显。有些县经济基础相对较好，加上西部大开发战略的实施，使得这些县域经济发展比较迅速。
四是自然原因造成的。南疆地处塔里木大沙漠这一“死亡之海”的边缘，降雨稀少，土地沙漠化相当严重，沙尘天气频繁，交通十分不便，生存环境十分恶劣。塔克拉玛干沙漠面积为33．76万平方公里，占全国沙漠面积的47．3％，是我国最大的沙漠地区。干旱少雨是这一地区突出的气象特征。南疆地区年降水量多在50毫米以下，仅为全疆年均降水量的1／4左右。同时，南疆地区处于西北风和东南风这两股风向交叉影响的地带，风沙活动频繁剧烈，塔克拉玛干南缘风沙天气年均在100天以上，个别地区甚至达到200天左右。沙尘暴发生时，总悬浮颗粒物监测浓度在6．46—50.65毫克／立方米范围波动，其降尘量大大高于北疆地区。因而造成地面植被相对稀缺，沙漠不断南移，以致于有的县出现了沙进人退的局面。而且，南疆三地州西有帕米尔高原耸立，南有绵亘东西的喀喇昆仑山，北有天山南脉横卧。身处山区的居民，居住十分分散，交通十分不便，气候恶劣，不时暴发山洪，几乎每年都有人畜被淹死亡的事故发生。
加之，人均受教育年限极其低下，人们的科学文化素质相当低。这种种状况表明，南疆各族居民的生存环境是相当严峻的。这是制约南疆发展不可忽视的因素。
三、政策改观
1.对口援疆
中央召开的新疆工作会议的政策影响之大，完全具有里程碑的意义。这一会议为新疆圈定的目标是：到2015年新疆人均地区生产总值达到全国平均水平，城乡居民收入和人均基本公共服务能力达到西部地区平均水平；到2020年新疆实现全面建设小康社会的"两个跨越式目标"。从这一系列目标中，可以感受中央政府推进新疆发展的决心之大。
19省市确定对口援疆，援建项目涉及城市、农村，遍布北疆、南疆。从资源开发，工业、农业，到文教、科技、医疗、环保，几乎无所不包。中东部地区19个省市区的领导纷纷带队到新疆调研，规格之高令人瞩目。与此同时，中央财政加大对新疆自治区和新疆生产建设兵团的投入，各部委的项目也"向西开放"。据了解，目前仅在新疆开工的铁路就有11条之多。这种以举国之力向一省区倾斜的措施，历来没有，世所罕见。
