1．自然区划的方法主要有叠置法、主导标志法、地理相关法、景观制图法、定量分析法等。叠置法是将若干自然要素的分布图和区划图叠置在一起，得出一定的网格，然后选择其中重叠最多的线条作为综合自然区划的依据。叠置法可以减少主观性和任意性，并有助于发现一些自然现象之间的联系。但是，自然界各种现象都有其发展规律，所处发展阶段也各不相同，特别是资料不完整的情况下，如果机械地运用叠置法，有时会得出错误结论。
主导标志法是在综合分析的基础上，选择主导标志作为区划的依据，由此得出区划界线，这种界线意义比较明确。但如果机械地运用这种方法，往往不能正确地表现出自然界的地域分异规律，区划界线有时会带有主观任意性。
地理相关法是在比较各项自然现象的分析图、分布图和区划图，了解自然界地域分异规律的基础上，再按若干重要因素互相依存的关系，制订区划界线的依据。
上述这些方法应当结合使用，它们的共同内容是根据自然界地域分异的因素，通过各种现象与对象因果关系的分析，选出可以作为区划依据的指标。
2．近年来，随着科学技术的发展，聚类分析方法与遥感分析方法逐步运用到自然区划中来。聚类分析是为了把互相差异的自然地理区域或现象进行分类和归纳。用相似系数与差异系数反映被分类对象之间亲疏程度的数量指标。两个客体之间的相似系数越大，其对应的差异系数就越小，这两个客体的关系就越密切，合并成一个区的可能性也就越大。相似系数的建立，需要用主成分分析，以便从众多的指标中，择取能反映客体本质，在数目上又尽可能少的主要指标。将择取出来的主要指标，在所要进行聚类的诸单元中给予数量化，并且统一评定其数量大小，即进行“标准化”，这样各类指标才具有等效值特性和可比性。然后，从中选用适合的方法聚类分析，进行定量的归类划区。
遥感技术为地理学研究提供了一种新手段，遥感图象综合地反映了地表的真实情况，能够提供宏观的、动态的各种自然现象的丰富信息，应用遥感图象结合地学分析方法，便于正确地揭示地域分异规律。
3．区划单位有一定的等级系统，可以“自上而下”顺序划分，也可以“自下而上”逐级合并。自上而下区划，主要是根据区域分异的大、中尺度差异，按照区域相似性与差异性，从区域的高级单位开始向低级区划单位逐级进行划分。自下而上的区划是从划分最低等级区划单位开始，然后将它们依次合并为高级区划单位。现有的全国性大尺度区划方案大多是自上而下的顺序划分法。
从大范围看，水平地带性是最显著的地域分异规律，垂直地带性是次一级的地域分异规律。区划时应首先表达水平地带性。水平地带性基本制约于温度和水分状况，综合这两个因素便成为最高级的综合区划单位。地形的差异又引起气候、水文、土壤、植被等自然条件与风化、侵蚀、堆积等过程有不同程度的差异，并反映出岩石组成、内营力等因素的差异。因此，地形是区划的重要因素。所以一般在划分温度带，干湿地区之后，再按地形进行下一级区划。