但各种植物对各种污染物的吸收能力不同，因而不同植物中各元素的含量，或同一污染物在植物体不同的器官组织内的累积量都有很大差异。因此，选何种植物或植物体的那一组织器官，作为度量土壤污染的指标，还需进一步研究和考虑。
3）生物指标 如植物反应，生长发育受到抑制，生态发生明显变异，土壤微生物区系（种类和数量）的变化，人们食用污染土壤上生长的植物性食物后对人体健康的危害程度等。但是影响生物的因素很复杂，进行毒理试验的难度也较大。
因此，在度量土壤污染时，最好要结合考虑土壤的背景值、植物体中有害物质的含量、生物反应和对人体健康的影响。但是它们并不完全一致，有时污染物超过背景值，但并未影响植物正常生长，也未在植物体内进行积累；而有时，土壤污染物虽然没有超过背景值，但由于某种植物对某些污染物的富集吸收能力特别强，反而使植物体中的污染物达到了污染程度。所以土壤背景值，只能作为土壤污染起始值的指标，或土壤开始发生污染的信号。土壤污染对人体健康的影响，还需要从食物链探索更为适宜的指标。
从上所述，可以说土壤污染是土壤所发生的一种障碍特征。它是用以推断人类活动影响土壤污染物累积的可容许或不容许的限度，以做为从事环境保护立法行动的根据。
为了预测和防治土壤污染的发生，必须很好地认识土壤污染物质，特别是对坏境污染直接或潜在威胁最大的污染物质，如化学农药和重金属等在土壤系统中的迁移转化过程的基本规律。