葡萄牙船只在印度洋的阿拉伯海及其沿岸来往频繁，给意大利商人带来沉重的打击。１５０４年，当威尼斯的大木船到贝鲁特和亚历山大进行一年一度的交易，向阿拉伯经纪人购买香料时，他们惊讶地发现，香料一点都没有了。原来葡萄牙人在印度已把所有的存货都买下了。
１４９９年７月１０日，经过２６个月探险航行的达・伽马远征队返回葡萄牙的京城里斯本。尽管生还者不及三分之一，舰队也只剩下两只满目疮痍的破船，国王还是热烈地欢迎他们，并且赠给伽马“印度洋海军上将”的称号，这是因为达・伽马发现了直达印度的水路，并带回了一大批赚钱的货物，价值是全部远征费用的６０倍。由于印度航线的发现，罗马教皇准许曼努埃尔国王自称为“阿比西尼亚、阿拉伯、波斯和印度的航海、征服及通商之王”。小小葡萄牙竟列入了世界强国，而东方的文明古国却被套上了殖民主义的枷锁。
魔鬼式的远征
１５０２年，葡萄牙对穆斯林和印度人的战争爆发。４月间，达・伽马统率全副武装的２０艘战船，气势汹汹地启航去印度。
印度洋是那么平静而美丽。马勒巴海岸一带，仙人掌、棕榈树葱茏繁茂，逶迤的山脉犹如卧龙匍匐在海边，间或可望见岸上那巍峨华丽的宫殿，闻到古刹寺院里飘来的缕缕香烟……
达・伽马的舰队开进印度洋后，这里的一切全变了，就像牧场里闯进了一群饿狼，葡萄牙人所到之处，到处都发生血战和意想不到的残杀。
在经久不息的射击和声震山岳的臼炮声中，阿拉伯商船和印度渔船成批成批地被击沉、烧毁。无辜的商人和渔民被吊在帆桁上，砍掉手臂、耳朵、鼻子。暴徒们用救世主和１２使徒的名义立起大绞刑架和火刑柱，在受刑者的脚下点起火，野兽般吼叫着，观看俘虏活活地烧死。
一旦登陆上岸，他们则用刀剑、长矛和凶猛的猎狗，向当地居民进行攻击。不管是小孩、老人还是妇婴，所有的人统统杀光。他们从母亲的怀里夺下婴儿，把脑袋往石头上撞。他们把香客抛入河里，看着浮起的水泡，幸灾乐祸地说：“这是离开异教徒躯壳的灵魂！”
达・伽马心满意足地完成了这次魔鬼式的远征后，在印度洋留下由８只轻快帆船组成的常驻舰队，予次年１０月“凯旋”而归。由于他为葡萄牙殖民主义立下汗马功劳，国王大加青睐，不仅封给领地，授于免税从东方贩运私货的特权，还赐以“伯爵”的称号。
为了进行更大的买卖和掠夺，使东方的黄金、白银源源不断地流入葡萄牙，达・伽马向曼努埃尔国王献计：设置印度总督一职。国王欣然接受了。
在东方人民的血泪和白骨上盖起的宏伟的宫殿里，在穷奢极欲、荒淫无耻的享受中，达・伽马度过了２０个春秋。
“主啊，饶恕我吧！”
１５２４年，达・伽马６４岁。他启程作第三次远征，赴印度亲任总督。舰队由１４只海船组成。他的两个儿子分别充当印度洋分遣舰队司令官、舰长。
这次远征出师不利。刚过莫桑比克海峡，气候转劣，逆风大作，３ 条舰连人带船一起毁灭。
在印度海岸达布尔附近，他们又遇到了海啸。船突然纵横颠簸，测深锤达不到海底，即使久经风浪的老水手也慌了。大家跪在甲板上，哭着乞求上帝怜悯。面对着巨浪滔天的大洋，达・伽马镇静自如，他向着人们大声呼唤：“朋友们，欢乐吧……甚至海洋也在我们面前发抖了！”谁也没有觉察到，在他的心灵深处，已笼罩了一层恐惧的阴影。
果然，这些不祥的预兆揭开了死神来临的序幕。
年底，刚坐上总督宝座不久的达・伽马，脖颈和后脑上的恶性脓疮猝然发作。在极度的痛苦中，老人干枯的手指抓着雪白的卧毯满床乱滚。最后他令人毛发悚然地嚎叫：“主，饶恕我吧！”然后气绝身亡。
１５３９年，达・伽马的遗骸由印度运回葡萄牙。他的墓碑上刻着：
“维迪盖拉一等伯爵，
东印度海军上将，
著名的印度发现者，
瓦斯科・达・伽马长眠之地。”