“我们从没听老师说过自主招生，校长推荐也肯定没我们的份儿，都是省重点中学。”在湖北省西部某县城中学读高二的林娟表示，自己所在的高中，一年能考上一两个清华、北大就不错了，而校长推荐制对高中的选择，都是由每年清华、北大的录取比例决定的。自主招生、联考，和自己一点关系也没有。
林娟说，对于欠发达地区普通高中的学生来说，无论是高考还是自主招生，他们都感觉越来越处于劣势。每年的高考中，农村学生比例都逐年下降。看了几道名校往年的自主招生试题后，她表示，这些题包含了很多时政内容，甚至还有现代诗、新锐电影，她根本看不懂也做不出来。“还不如高考，死记硬背对于我们来说，反而胜出的几率更大。”作为班里的前三名，她说，如果发挥失常，高考少考几分，就会失去上大学的机会。“农村的孩子以前相信高考能改变命运，现在已经不相信了。考上一个三流学校，还不如在家种田。”
相比而言，在上海读书的上海市位育中学学生顾宁宁(化名)则没觉得有什么不对。在她看来，在综合能力、眼界甚至英语口语这些方面，上海学生无疑在全国是遥遥领先的。“既然是公平选拔，就应该以能力和素质为评判标准。”她说。
针对城乡差异，2011年各高校的自主招生政策，已经开始对欠发达地区的优秀考生进行适当的政策倾斜。据悉，“清华七校”联考考点将计划由去年的26个省份、29个城市增加至30个省份的33个城市，增加内蒙古呼和浩特市、海南海口市、宁夏银川市、青海西宁市。“北大七校”联考也宣布将面向全国所有省市和自治区的学生。
而北京大学的“中学校长实名推荐制”，获得推荐资格的中学已有一批县级、农村中学和少数民族地区的优秀中学。清华大学则首次推行自主招生试点“B计划”，针对欠发达地区的优秀考生，专家组将对初试成绩要求适当放宽，而通过“B计划”录取的学生，除按照学校的规定给予经济资助外，还将在学业和成长等方面给予一定的帮助和指导。
21世纪教育研究院副院长熊丙奇认为，在目前现状下，农村学生在自主招生过程中，确实会觉得受到了权利的伤害。他建议，仿照美国的做法，使贫困地区家庭的孩子在自主招生中得到加分评价，如在自主招生中规定比例，来自农村的学生必须占30%。
熊庆年则认为，改革需要社会条件的支撑，美国高校的市场化程度很高，弹性很大，社会监督和约束也比较成熟，和中国的现状差异很大。教育的不公平，还是归结到中国区域大，发展又不平衡，这不仅是自主招生才有的问题，在曾经的全国统一高考中，也存在着不同地区的差别。既然是考试，就不能完全按个人禀赋，达到各取所需，现在的一流高校也只是为了选拔到适合自己的人才在进行探索。“公平是一个非常复杂的问题，自主招生会涉及公平，但不要简单的把不公平和自主招生联系在一起。”
联考只是过渡
丁光宏表示，现在的这种联考形式，并不是自主招生形式的结果，而只是一种过渡，但是在朝着好的方向发展。5年前，复旦大学曾展开“自主选拔录取改革试验”，在全国率先以“千分考”和教授团一对一面试实行预录取，高考成绩仅作为参考。“改革还会不断往前走，冰已经破开，但还要穿过冰，达到我们真正的目的，参加联考只是其中一部分。”丁光宏说。
熊庆年表示，在高等教育大众化的年代，未来高考制度要进一步改革，使高校能够选拔符合自己标准的学生。在改革中，方向是清楚的，要多元化、多样化，同时尽可能降低社会成本，但招考牵涉面很广，种种矛盾汇集，改革有一个渐进的过程，不可能一下子解决所有的矛盾，要探索了才知道。
熊丙奇也认为，目前的联考只能是过渡模式。学校获得自主招生资格后，各行其是、各自为政的进行自主招生测试，让学生疲于奔命地赶考，考试却大同小异，不适应自主招生的有效推进。他建议学习美国的多元评价体系，即学校不单独对学生进行笔试，而是基于SAT、ACT、AP等成绩，结合中学成绩；联考不和学校绑定，而是自由竞争，自由参与，自由认领。
熊丙奇建议，更多高校举行联考，逐渐形成“学业水平测试+自主招生”模式，而此举关键在于学生要有充分的选择权。对现有的联考制度而言，首先要错开笔试时间，让学生可以参加任何一个联考；二是联考后，七所学校都应该接受考生成绩，而不应只能填报三所学校，且必须错开面试时间。
他还建议，有的学校即便没有参加现有的两大联考，也可以认同联考成绩。美国SAT考试最初是哈佛大学对学生的智力测试，最后变成新生入学测试，推荐给更多学校使用，别的学校也纷纷采纳。
熊丙奇认为，如果能更进一步，组织比较权威的联考，就可以取代统一高考。“如果自主招生扼杀学生选择权，就是增加学生负担；如果扩大学生选择权，让每一次考试都能在录取过程中发挥作用，就是减轻学生负担。以此为依据，过去的所有自主招生都是增加学生负担。”但他仍然认为，目前的自主招生联考及结合高考成绩的制度，是朝好的方向发展的。最根本的，就是自主招生应该回到应有的面目上来，保护学生选择权和教育竞争，而不能再出现操作上的问题，千万不能“有其形而无其神”。