万石岩植物园占地4平方公里，热带、亚热带植物种类繁多，集中外之名贵，被誉为“海山花”绿色博物馆。
植物园引种世界棕榈科植物百余种，兰花圃引种200多种兰花，标本楼天台上的温室，是一个仙人掌科多肉植物的世界。有一个名叫金鯱的仙人球，直径近一米，居全国之冠。
植物园里有水杉、银杏等“活化石”；有美国红杉、智利南洋杉和来自澳大利亚的桉树，树姿优美；各种热带花卉争奇斗艳；培植的盆景千姿百态，一个古榔榆盆景，树龄已有300多年，其图像已印成纪念邮票。
万石岩中24景之一的中岩玉称笏，因常有鹧鸪栖息，又名鹧鸪岩。此去不远便是中岩天竺寺，寺旁古树参天．岩石嶙峋．石刻颇多。附近有榕树枝叶倒挂洞口的玉泉洞，洞中有石床、石桌，可供游人小憩。另一景太平石笑，由四块巨石相叠而成，好似开口畅笑，此处还是民族英雄郑成功当年屯兵厦门时的读书处。还有一景天界晓钟，每当晨曦初露，在一块似骆驼又似醉仙偃卧的巨石下方的天界寺内，僧人撞钟108下，钟声悠悠，催人梦醒；深山古刹，朝钟暮鼓，给人以恍惚出世之感。
寺下方有洞．洞中有泉．其水甘甜，又名醴泉。又一景紫云得路，地处山崖狭谷，上有松荫遮日，下有流溪湍急，显得分外幽静。