特别引人注目的是“硫磺皇后”号，在１９６３年２月２日经佛罗里达海峡时失踪。因为这是一艘大型货船，船员有３９名。失踪数天以后，海岸警卫队的飞机和舰只才开始搜索，至２月１５日搜索中断。但五天以后，海军报告在基韦斯特以南海面上发现了“硫磺皇后”号上的一件救生衣。于是，搜索又重新开始了，结果仅仅找到了另一件救生衣。随后调查失踪的原因，认为可能是硫磺爆炸，或是撞上了水雷，甚至可能是被古巴人劫持等等。
１９７３年３月，一个风和日丽的日子里，一艘载有３２人的摩托艇驶进这一海域，瞬间艇沉海底，人员全部罹难。
飞机和船只在百慕大三角海域不断神秘地失踪，使得越来越多的人意识到，在这一地区存在着一个使人莫解的具有严重威胁性的谜。为了解开这个谜，科学家和探险家纷纷前往考察探险，运用了事件分析、模拟实验等多种方法，提出了各种各样的猜测和假说：
百慕大三角海域存在着一个强大的磁场，干扰飞机和船只的正常航行，并导致机、船遇难。
百慕大三角区海底有一个巨大的暗洞，它穿越美洲大陆，直通太平洋。这种巨大的洞穴，产生一股极大的吸力，过往的飞机和船只，就可能被吸到海底。
百慕大三角区海底存在黑洞，黑洞是一种死亡了的星球，当它的能量用完之后，便出现奇妙的“内缩”现象。这种“内缩”的吸力极强，连光线也能被吸进去，因为没有光发射出来，所以是个黑洞，但可以探测到。大约在１５００年前，有一直径约５０公里的巨大陨石，坠落在百慕大三角区的海底，产生的巨大撞击力能量全部消耗殆尽后，便出现“内缩”，同时产生强大的吸力。从那时起，过往的飞机和船只自然会被黑洞吸进去。
百慕大三角区海面布满了直径数千米，甚至数百公里的巨大漩涡。这种巨大的漩涡从海底旋到海面，能产生一个强大的电磁场，导致飞机、船只失事。
百慕大三角区存在直径约２０００公里的巨大漩涡。它就像一面巨大的凹面镜，在阳光入射角 ６０－７０°时，聚焦点直径可达数百至千米，其温度之高，足以使飞机和船只顷刻间熔化，即使稍有靠近，也能引起爆炸烧毁。夜间能将星光、月光聚焦，使磁场扰动，造成飞机、船只上的仪器失灵，导致机、船毁灭。
百慕大三角区海底有许多孔洞，这些海底孔洞，不断放出甲烷和其它有毒气体，机、船人员吸入这种气体便窒息而死，而机、船被急风恶浪吞噬。
百慕大三角区海域的海底，沉积了一层由动植物遗体和沉船等组成的“水合物”。这层“水合物”一旦海底火山爆发或受海洋暖流的冲击，就会溶解，产生大量甲烷。甲烷从海底上冒，形成无数气泡，使海水压力减小。气泡上冒到海面破裂，便造成海水的“中空”，当船只由“实水”驶入“虚水”区时，虚水因无支撑船只重量，便沉入海底。飞机经过这一海域时，因甲烷将空气中的氧气“逼离”，造成缺氧熄火而坠落。飞机在坠落过程中，从排气管中排出的灼热，带有火花的废气，引燃四周的甲烷，将飞机烧毁。
上述的各种猜测或假说，对百慕大三角之谜都作了解释，但由于论据不足，还不能令人信服。
此外，还有人提出，海啸或特大龙卷风、晴空湍流与神秘百慕大三角的关系。海啸能形成巨波，使过往船只突然倾覆或沉没，有时即使是一条大船，也会被巨波击成两截，可是难以解释飞机的失踪。特大龙卷风形成一个高大的水柱，使过往船只甚至低空飞行的飞机失事。晴空湍流可摧毁飞机，但不能吞没船只。
也有人认为，海底有金字塔，因而造成了百慕大三角之谜。据报道，最近在百慕大三角海域，一些海洋学家在海底发现了两座巨大无比像玻璃样的金字塔，而且认为这两座金字塔不是远古时代建造的。负责深海搜索行动的海洋学家韦拉・梅亚博士说，他是在１９９２年４月一次例行海洋测量工作时无意中发现的。金字塔位于美国迈亚密布市以东约１０００公里处水深６００多米的海底。从声纳仪测得的资料，亦显示出这两座金字塔起码有２００多米高，基底阔达６００多米，比埃及帝王宫的最大一座金字塔还要大上１倍左右。海底金字塔的存在，改变海流运行的形式，可能导致来往船只遇难，但难以造成高空飞机毁灭，即使导致机、船失事，也只能限于局部的海域。
其他还有飞机、船只被外星人的飞碟所俘虏或被海底巨大“海怪”所吞噬；炸毁飞机的空中火球；导致飞机、船只失踪的重力异常、自然激光、次声波等等，不一而足。
最近，由美国、前苏联和法国科学家组成的调查《百慕大神秘三角》之谜的小组，利用在太空运行的人造卫星进行侦察，揭开了这一神秘的百慕大三角之谜。根据激光扫描的照片发现，在这个三角地区有一个威力无穷的巨型湍流漩涡。领导这个调查小组的首席科学家阿科尔博士表示，这个巨型漩涡出现时只不过３秒钟，但其威力无穷，令人难以置信。它的吸引力之强，比地球上任何飓风、大地震或火山爆发的威力都强得多，与月球影响地球潮汐的万有引力相比毫不逊色，它可以影响月球上的天气。这个巨大的漩涡出现时，飘忽不定，难以测摸，要在大西洋寻找到它，真像大海捞针。这也是前人未能解释百慕大三角之谜的主要原因。当突如其来的巨大漩涡出现时，所向披靡，海上的舰船，九霄云空的飞机，都将被卷入海底，造成机、船失踪。那末，这么大的巨型湍流漩涡，究竟是怎样形成的呢？这个问题，还有待于人们去进一步探索。