水体富营养化是一种有机污染类型，由于过多的氮、磷等营养物质进入天然水体而使水质恶化。过多的营养物质促使水域中的浮游植物，如蓝藻、硅藻以及水草的大量繁殖，有时整个水面被藻类覆盖而形成“水花”，藻类死亡后沉积于水底，微生物分解消耗大量溶解氧，导致鱼类因缺氧而大批死亡。水体富营养化会加速湖泊的衰退，使之向沼泽化发展。“三河三湖”是指流经我国人口稠密区的淮河、海河、辽河和太湖、巢湖、滇池，其水体富营养化严重，是我国治理水污染的重点目标。
海洋近岸海区，发生富营养化现象，使赤潮藻类等大量繁殖、密集在一起，使海水呈粉红色或红褐色，称为赤潮，导致鱼类死亡，对渔业危害极大。近年来渤海北部和南海已多次发生赤潮灾害。
2．有毒物质的污染
有毒物质包括两大类：一类是指汞、镉、铝、铜、铅、锌等重金属；另一类则是有机氯、有机磷、多氯联苯、芳香族氨基化合物等化工产品。这些污染可以急性或慢性地毒害人的身体健康。有毒物质主要通过化工厂泄漏、农药残留等方式进入水中，近年来，我国多处出现的“癌症村”，与水的这种污染关系密切。
3．海水入侵
沿海地区，由于人为超量开采地下水，使地下水与海水的动力平衡破坏，海水侵入滨海地区地下水中。海水入侵使灌溉地下水水质变咸，土壤盐渍化，灌溉机井报废，导致水田面积减少，旱田面积增加，农田保浇面积减少，荒地面积增加。最严重的会导致工厂、村镇整体搬迁，海水入侵区成为不毛之地。中国海水入侵主要出现在辽宁、河北、天津、山东、江苏、上海、浙江、海南、广西9个省份的沿海地区。最严重的是山东、辽宁两省，入侵总面积已超过2000平方公里。
4．咸潮的影响
咸潮，又称咸潮上溯、盐水入侵。咸潮是沿海河口附近的一种水文现象，它是由潮汐带来的海水运动引起的。
咸潮多发生在河流入海口处，河流枯水期时，由于上游来水不足，河口区水位下降，当海水涨潮时，受海水顶托作用，海水比较容易倒灌入河，咸淡水混合，致使河口地区淡水资源受到严重破坏。
近年来，咸潮的发生范围和次数不断增加，除了与大气变暖引起海平面上涨、流域内气候干旱有关外，还与人们在流域内破坏植被、截留河水、滥采河沙、用水量过多等行为有关。
我国大部分地区属季风气候，降水有明显的季节变化。旱季时，河流处于枯水期，咸潮影响明显增强。若遇到大旱年份，咸潮危害更大。例如我国长三角、珠三角周边地区，时间主要发生在每年十月至次年三月之间。
咸潮来临时，对居民生活、工业生产以至农业灌溉都有相当大的影响。自来水会变得咸苦，难以饮用；长时期饮用氯化物含量多的水对人体健康危害较大。工业生产使用含盐分多的水会损害机器设备；农业生产上，使用咸水灌溉农田，会导致农作物萎蔫甚至死亡。
长江口内咸潮入侵示意图