农业生产同时受自然、技术和经济三类因素的综合影响，具有综合性的特点。自然是发展农业的基础，技术是发展农业的手段，社会经济条件对农业发展起着决定性作用。只有把自然、技术和经济三方面综合起来进行研究，才能正确地阐明和揭示农业生产地域分异及其规律。
地域性和综合性是农业地理学的特点。农业地理学处于地理科学和农业科学相交接的领域，在农业地理学发展史中研究农业地理问题的，既有地理学者，也有农业学者。瑞士农业地理学家伯恩哈特1915年发表的理论文章《论作为科学部门的农业地理学》，把农业地理学、系统农学(各种农业技术科学和农业经济学)及农业史并列为农业科学体系的三个组成部分。
为了正确理解农业的自然再生产过程及其与制约这个过程的各种自然条件的关系，必须借助于农业气候、农业土壤、农业水文、农业生态学、自然地理学等一系列自然科学的研究成果。为了正确理解人类对生物再生产过程进行有效干预和调节的种种方式方法，必须借助于植物栽培学、动物饲养学、森林学、耕作学、土壤改良学、水利科学等农业技术科学的研究成果。
为了正确理解农业的经济再生产过程，必须借助于农业经济学、农场管理学、国民经济计划、国民经济史等经济科学的研究成果。为了有效地开展农业地理研究，还必须借助地图科学、统计科学、遥感技术等已有成果和手段。农业地理学经常从这些相关科学吸取营养，增强它的科学性。边缘性是农业地理学的学科特点，同时也是农业地理学的难点。
长期以来，农业地理学的主要研究方法是通过实地调查访问，包括野外直接观察、向生产者或生产主管单位进行访问；搜集分析有关统计资料和文字资料；编制各种类型的农业地图；根据上述资料利用地理比较法、类型—区划法、综合分析法等，揭示农业生产地域分异，分析研究农业地域结构、类型和区域的特点、形成因素、变化发展过程和趋向。
把传统的地理科学方法同新技术方法结合起来，实行定量研究与定性研究相结合，实地调查与文献资料分析相结合，地图表现与文字分析相结合，单项研究与综合研究相结合，宏观研究与微观研究相结合等方法。通过各种方法的综合运用，才能更好地促进农业地理学的发展。