办学以来，在“精医、尚德、求实、自强”校训的基础上，凝练出“艰苦创业，求实自强，奉献社会”的皖医精神，形成了优良的办学传统。认真贯彻党的教育方针，坚持面向社会、面向基层的办学方向，为国家输送了三万余名医疗卫生人才，为我省乃至全国的医疗卫生事业发展作出了积极的贡献。近几年毕业生就业率均在95％以上，在全省高校中处于靠前位置，多次荣获省就业工作先进单位称号。
站在新的历史起点上，学校明确了逐步建设成为以医学为主、多学科协调发展、布局合理、结构优化、特色鲜明的教学研究型院校的发展目标。面对新形势新任务，学校将秉承优良办学传统，深入贯彻落实科学发展观，继往开来，锐意进取，努力谱写皖南医学院发展的新篇章！