预防硒中毒最有效的办法就是使人和动物避免摄入富Se的食物和饲料，美国采取除去富Se牧草或更换草场的办法来预防。有些牲畜也有识别富Se牧草的能力，因有些富Se牧草会散发出一种蒜臭味。另外，土壤中含硫多会抑制植物对 Se的吸收，因此，有些国家采取在草场施用石膏或含 S肥料等措施，来降低植物含 Se量。陕西近年来采用换粮的办法，对预防人体硒中毒也收到良好的效果。
硒中毒的治疗，主要是如何降低以至消除硒的毒性。研究证实，进食含 Se 15ppm的富Se谷物所引起的急性或慢性硒中毒，可以用含有5ppm亚砷酸钠的饮水而得到缓解或完全去毒。砷的功能在于增加硒经胆汁排入肠胃道，最后排出体外，蛋氨酸可以防止硒中毒，但口粮中必须有足够的维生素E。除蛋氨酸外，甜菜碱和胆碱也能在抵抗硒酸盐的毒性中起一定作用。口粮中的硫酸盐可以减轻硒酸盐的毒性，但不能减轻亚硒酸盐或有机硒的毒性。亚麻子油饼也有拮抗硒中毒的作用，后来，吕文特尔（Levander）对这一发现作了进一步研究，他认为决定硒这个元素毒性的最重要因素是组织中硒的化学形态，而不是组织中硒总量的多少。他的结论是，喂亚麻子油饼以后，硒的化学性质发生了改变，经过这种化学改变后的硒，对动物的毒性降低了。Hg、Cd、Cu、与Se均有拮抗作用，能降低 Se的毒性。VE是一种良好的抗氧化剂，可预防硒中毒，蛋氨酸分子可以与机体内过量的硒结合，从而起到解毒作用。因食入高硒（含Se 15mg），而引起的急性和慢性中毒者，服用5mg的Na2AsO3水溶液，可促使过量的砷经胆汁排泄到胃肠道，最后从肾脏排出体外，以达到缓解毒性或完全解毒的目的。