有些气象学家则把信风的减弱归咎于异常的海面高温。他们认为，如果赤道太平洋中部异常暖水引起当地大气增温，那么进入该区的低空气辐合，就使赤道太平洋西部和中部上空西风异常的加强，从而使偏东信风减弱。
海洋、气象学家争论的对立，意味着厄尔尼诺事件是海洋和大气之间的不稳定相互作用引起的。由于厄尔尼诺事件与人类关系密切，科学家研究的目的不仅要弄清其原因，而且希望能提前对它作出准确预报。最近科学家认为，利用卫星监视海洋和大气，有可能对厄尔尼诺事件作出预报。
我国东北地区，特别是黑龙江省无霜期短，温度对农业有显著影响。如果夏季温度偏低，可以造成农业大幅度减产。据统计，在1955—1981年间，发生过5次低温冷害，这些低温冷害的年份，恰好都是厄尔尼诺事件年（表4-10）。
厄尔尼诺事件与辽宁省水稻产量关系也很密切。统计表明，厄尔尼诺年往往也是辽宁水稻减产年。从1964年到1979年的16年间，辽宁省水稻有三次大幅度减产年，全部出现在厄尔尼诺事件年。而反厄尔尼诺事件年往往是辽宁省水稻丰收年。其余则为正常年景（表4-11）。