地理成分复杂中国植物区系的地理成分甚为复杂，分布交错混杂。根据对中国现知2980属种子植物的比较分析，可划分为15个分布区类型和31个变型（表3）。
表3中，热带成分（2～7类）共有1460多属，占全国属数51.1％（不包括世界分布属，下同）；温带成分（8～11，14类）930余属，占32.5％；古地中海成分（12，13）和中国特有成分备占9.7％和6.8％。在东亚—北美和东亚分布属中还有许多热带—亚热带成分。可见中国植物区系具有明显的热带起源性质。
各种成分既有其主要分布地区或分布中心，又是相互渗透混杂的，如中国典型的泛热带分布的326属中，只有60属限于热带，而有150属分布到亚热带， 110多属分布直达温带，即达到它们分布区的北界。至于温带分布的科属，几广布全国，但往往主要产于江南至西南的亚热带地区。古地中海区的成分主要产于西北干旱地区，亦有分布到华北或西南者，如柽柳和川续断科的一些属种。这种分布趋势显示了中国植物区系的来源及其热带起源。
特有成分繁多中国特有植物计有200属左右，归72科，其中含10属或10属以上的为菊科、苦苣苔科、伞形科、兰科和唇形科5科，但多数为热带—亚热带（29）和温带（22）分布科。银杏科、钟萼树科、珙桐科及杜仲科为4个特有科。
这些属中除铁线山柳和川木香、毛舌菊等5～6属为多种属外，其余95％以上都是单种或少种属，并且绝大多数是古老或原始的类型，如前所述的白豆杉等，还有如五加科的通脱木、马兜铃科的马蹄香、蜡梅科的蜡梅、榛科的虎榛子、石竹科的金铁锁、金缕梅科的牛鼻栓、半枫荷、毛茛科的独叶草及菊科中少有的木本属蚂蚱腿子和护菊木等。4个特有科也都是单种的古老科。它们主要分布在秦岭—山东以南的亚热带和热带地区，特别集中于西南至华中—华东。
植物区系的起源从以上所述，可以认为中国植物区系来源于南、北古陆和古地中海区，而它们又为热带统一起源的。各种热带分布区类型起源于古南大陆已为现代多数植物学者和古植物学者所论证；至于温带区系的热带起源问题，至今犹未获一致认识。
中国特有成分的起源是相当复杂的，不但有特有属，而且有特有科。银杏科、杜仲科和珙桐科、钟萼树科皆为单种，后2种可能分别与榆科、猕猴桃科和无患子科相近，含2个相近种，是很有趣的孑遗分子。此外，在许多原始或较古老的科中，如木兰科、樟科、木通科、蜡梅科、山茶科、猕猴桃科、金缕梅科、省沽油科、无患子科、桑科、榆科、槭树科、胡桃科等木本科及毛茛科、三白草科都出现中国特有属。它们和白豆杉、水杉、银杉等松杉类第三纪残遗植物一样，主要集中分布于中国北纬20°～40°的西南至东南部山区。因此它们无疑起源于古北大陆南部，在第三纪前即已形成和分化。此外，在这一范围内及西藏也有少数新生类型，如菊科、苦苣苔科的一些属。