1．对土地资源的影响
矿产资源开采要占用和破坏大量的土地，仅露天采矿全世界就已有300万公顷土地被破坏，我国每年露天采矿破坏的土地约0.67—1万公顷。在矿产资源开发中，以煤炭开发对土地资源的破坏最为严重，井下每采百万吨原煤造成的土地塌陷面积平均为13.3—20公顷。我国的40个煤矿区，截止1984年累计塌陷农田已达9.04×104公顷。矿产资源开发中排出的各种废弃物和尾矿也要占用大量土地，仅煤矸石全国就共占用地土约4000公顷。金属矿山排弃的土石、尾矿堆积总量已超过1.0×1010吨。不仅如此，露天采矿还直接导致地面景观的破坏，使大片完整的土层绿地被剥光，成为基岩裸露废石遍地的不毛之地。同时由于大量土石倾倒在山坡上，植被被弃土完全覆盖，疏松的土石堆在山坡上，极易形成水土流失。
2．对水资源的影响
为了防止地下水涌入开采坑道和露天采场，必须降低地下水位，通常所用的办法就是打深井和抽水。大量的抽水和打深井，使地下水位降低，导致矿区周围的井泉干涸，灌溉和生活用水都很困难，山西五阳煤矿周围12个自然村15年来，地下水位下降3—8米，造成人畜饮用水都出现危机。
矿产采选过程中排出的污水对水源的污染也很严重。宁夏大武口洗煤厂泥池中沉淀后的废水漫流排放，形成了约20平方公里的煤泥沼泽，煤泥废水中悬浮物含量极高，在沼泽地周围潜水中，已检出几种有害物质。
3．对生物的影响
矿产资源冶炼加工过程中排放出的有害气体是大气污染的主要来源之一，这些有害气体进入大气后，有的直接被动、植物吸入，造成它们受到毒害，严重时还会造成它们的死亡；另一部分有害气体，特别是硫氧化物和氮氧化物进入大气后，依盛行风向的强弱，随雨雪降落在离排放地几十到几百千米，甚至几千千米以外的地方，形成酸雨。酸雨的危害很大，影响面很宽，现已成为世界性的环境问题，酸雨最明显的影响是对湖泊渔业的影响。挪威西南部地区的酸雨，使那里的湖泊水的PH值降低很多。PH值低于4.3的湖泊70%以上已没有鱼存在，而PH值在正常范围内的湖泊中，没有鱼的不到10%。
矿产资源在运输过程中，对生物所造成的危害也很严重，这种危害当首推海洋石油运输对海洋生物的危害。世界每年由于油轮相撞、爆炸、沉没、溢漏及其它损耗，每年约有1.0×108吨原油流入海洋。大量原油泄漏，造成大面海洋石油污染，对生物的危害也特别严重。据研究，柴油浓度在0.01—0.1%时就会损害褐藻的光合作用；低沸点饱和烃对海洋无脊椎动物的毒害特别严重。海洋石油污染的最大的受害者是海鸟，它不仅造成大量海鸟的死亡，而且受害海鸟被营救释放后，常呈现较高的死亡率。这种影响还通过食物链影响其它生物和人类。