改革开放后，特别是进入90年代以来，云南大学加快了发展。1996年，云南大学成为“九五”期间国家“211工程”重点建设的高校之一。以此为契机，学校提出“立足边疆、服务云南、办出特色”的办学思路，以“211工 程”建设为龙头，以改革为动力，以党建和思想政治工作为保障，把学校工作与地方经济、社会发展紧密结合起来，使云南大学进入了建国后发展最好最快的时期。2001年6月，我校“211工程”、“九五”建设顺利通过验收，获得了专家组的高度评价，受到教育部领导的表扬。
目前，云南大学已成为一所以民族学、生态学为特色，文、史、哲、经、管、工、理、法、教育等学科内容较为齐全、人才密集的全国重点综合性大学。学校现有教职工2723人，专任教师1475人，全日制本科生12468人（不含三个独立学院学生15379人），研究生近7000人，各类成人教育学生近20000人；下设16个学院、7个研究院、3个公共课教学部、1个留学生院，其中软件学院是教育部批准的全国35所国家级示范性软件学院之一，共设69个本科专业（其中省级重点专业11个）；拥有民族学、生态学、专门史、微生物学4个国家级重点学科，36个省级重点学科；有3个一级学科博士学位授权，53个二级学科博士学位授权，民族学、历史学、生物学、数学4个博士后科研流动站和1个企业博士后科研工作站，23个一级学科硕士学位授权，158个硕士学位授权以及MBA、MPA、工程和法律硕士等4个专业硕士学位授权；拥有国家示范性软件学院，历史学、生物学、数理专业3个国家基础学科人才培养与科学研究基地和1个教育部生命科学与技术人才培养基地，1个国家大学生文化素质教育基地，2个国家人文社会科学研究中心，1个省部共建国家重点实验室培育基地、2个教育部重点实验室、2个省级重点实验室、3个省级高新技术创新人才培养基地、2个国家级实验教学示范中心、4个省级实验教学示范中心、1个国家Linux技术培训与推广中心。
云南大学现占地面积2111亩，其中校本部568亩，洋浦校区1543亩；公用校舍建筑面积86万平方米；固定资产145069万元；图书馆藏书257多万册；学校设有出版社，并主办《思想战线》、《云南大学学报》（自然科学版、社会科学版和法学版）等十余种学术刊物。学校现与美国、加拿大、欧洲、澳洲、日本、台湾等国家和地区的近百所大学和科研机构保持着长期的交流与合作关系。
进入21世纪，云南大学作为云南唯一一所实施国家“211工程”的地方综合性大学、国家西部重点支持高校和省部共建高校，肩负着光荣的历史使命和时代重任，全体云大人将秉承“会泽百家、至公天下”的云大精神，继续遵循“立足边疆，服务云南，办出特色”的办学思路，抓住机遇，团结一致，开拓创新，锐意进取，为云南省经济建设的发展和国家实施西部大开发战略作出更大贡献。