山东中医药大学原名山东中医学院，创建于1958年，1978年被列为全国重点建设的中医院校，1981年成为山东省重点高校，1996年更名为山东中医药大学， 2007年由济南市历下区主体迁至长清大学科技园，是山东省唯一一所独立设置的医药科大学，教育部本科教学工作水平评估优秀学校。
“功能齐全、数字化、园林化、现代化、有特色”的新校区办学条件优越，总占地1829亩，建筑面积50.4万平方米，仪器设备总值8090万元，馆藏纸质图书98万册、电子图书47万册，有配置完善的计算机校园网和现代教育技术设施。学校设13个二级学院，有2所直属附属医院和8所非直属附属医院、23所教学医院、50处临床教学基地。
学校拥有完备的教育层次。有21个本科专业，涉及医、理、文、工、管等学科门类；有中医学、中药学、中西医结合3个博士学位授权一级学科，15个博士点；5个硕士学位授权一级学科、26个硕士点，硕士点涵盖了中医学、中西医结合、中药学全部二级学科，并开始向周边学科渗透；拥有临床医学专业博士和硕士学位授予权。截至目前，学校全日制在校生14436人，其中本专科生12167人，研究生2010人。学校十分注重对外交流与合作，先后与亚洲、欧美、非洲、澳洲等国家和地区的十余所大学、医疗机构建立并保持长期友好合作关系，合作办学、合作办医,有外国留学生、境外合作办学学生、港澳台学生280余人。
学校注重加强学科建设，形成了一批优势和特色学科。现有中医基础理论、中医医史文献2个国家重点学科和中医内科学1个国家重点（培育）学科，1个教育部重点实验室，1个国家卫生部技术准入专科；国家中医药管理局重点学科12个，重点专科(专病) 3个、重点建设专科5个，重点中医药科研实验室（三级）6个；有山东省“泰山学者”岗位学科6个，山东省人文社科研究基地1个，省级重点学科、重点专科、重点实验室等14个。
学校具有较强的科技创新能力。有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，设有4个研究所、6个研究室，2个国家中医药管理局重点研究室，3个山东省工程技术研究中心。近3年以来获国家科技进步二等奖2项、山东省科技进步一等奖2项；2007年在省属高校中首次主持国家“973”项目1项，承担“973”项目课题3项，牵头国家“十一五”科技支撑计划项目3项。是科技部认定的“国家科技成果重点推广项目技术依托单位”、“国家中药现代化、产业化规范种植项目承担单位”。
学校拥有实力雄厚的师资队伍。现有教职医护员工3325人，校本部1006人，博士生导师78人，硕士生导师311人。1人先后荣获国家“国医楷模”、“国医大师”荣誉称号，有国家“973”项目首席科学家1人，全国杰出专业技术人员1人，全国优秀教师8人，省部级有突出贡献的中青年专家10人，山东省“泰山学者”特聘教授6人，享受国务院特殊津贴41人，山东省有突出贡献的名老中医药专家5人，山东省名中医药专家44人，1个团队入选山东省十大优秀创新团队。
学校正在十七大精神指引下，以科学发展观统领学校全局，继续解放思想，深化改革，科学发展、和谐发展、率先发展，加快实施“两步走”发展战略，认真落实“教学立校、科研兴校、人才强校”基本方略，突出特色谋生存，形成优势求发展，努力建设强校，服务社会、服务经济、服务群众，为富民强省、构建和谐社会做贡献。（截至2010年1月）