本区位于我国水陆交通的枢纽地带，交通运输业发达。
1．长江航运线。长江是我国最重要的河运干线，由干流和汉江、湘江、赣江、信江以及淮河、京杭运河构成东西向和南北向运输于道。通航里程、客货运量分别占我国内河的72％和80％，尤其是下游地区，内河承担了当地货运量的50％，江苏、浙江甚至高达60％，中游地区水运量也占到货运量的24％。
目前长江水系共有船舶24万多艘、1000×104t运力、大小港口1000多个、吞吐能力 5.5×108t。
长江干流武汉以下可通航5000t级以上海轮，南京以下可通航2.5×104t级海轮。江海直达和江海联运业务是陆上运输方式无法替代的。
长江径流大而变幅小，来水过程较为稳定，有利于开发航运。但河道多宽窄相间的分汊河道，汊河道处水流分散，枯水期形成碍航浅滩，严重影响航行，需要整治航道，才能充分发挥内河航运的巨大潜力。
2．海洋运输。本区东部沿海的上海、江苏、浙江在全国海上运输网中具有中枢地位。
上海港是全国最大的港口。按目前的货物吞吐量（1.5×108t上下），上海已是世界第三大港。由上海至南京间长江两岸共建有110多个万吨级以上的海轮泊位。南京新生圩港、镇江大港、张家港港和南通狼山港四个深水港区开放后都显著增加了吞吐能力。目前吞吐量约8000×104t，上海港及长江下游南京、镇江、张家港、南通正进行统一规划，将建为中国最大的现代化港口群体。
宁波港吞吐量已突破7000×104t，舟山港建成了23×104t级的石油码头。杭州湾北岸的乍浦港与上海金山紧连，已建有104t级的散货码头和 2.5×104t陈山石油码头。连云港是苏北沿岸的深水外贸海港，通过陇海线使港口的腹地直接延伸到中原和西北。
浦东新区的开发也推动了对外航运的发展。外高桥的4×104t级泊位已建成投产。金桥区还有一系列大吨位泊位正在建设。
上海处于环球海运航路行经亚太经济繁荣地区的连线上，在世界海运中占有重要地位。上海港已有近150年的国际通航史，国际海运可通往160多个国家和地区的600多个港口。建成以上海为中心的长江口国际海运中心是适应中国逐步走向国际化，实现经济振兴的一个重要步骤。
（3）纵横交错的陆路运输网。铁路干线在长江南北形成了纵横交错的干线运输网（图12．2．1）。
南北向的铁路有京沪—沪杭线、京九线、皖赣线、京广线、焦枝—枝柳线，东西向干线，北有陇海线、南有沪杭—浙赣—湘黔等线组成。此外还有湘桂、襄渝、汉丹、宁（南京）、铜（铜陵）、宜（州）杭（州）等。规划建设的有京沪高速铁路、沿江铁路、从石（门）长（沙）线上的益阳经娄底、冷水滩至玉林新铁路干线等。
公路国道包括204线（烟台—上海）、324线（上海—广州）、107线（北京—郴州）、207线（长治—枝城—湛江）、209线（怀化—柳州）、310线（连云港—西安）、上海—成都国道主干公路。交通部确定的45个全国性的公路主要枢纽中，本区占12个（上海、南京、徐州、连云港、杭州、宁波、温州、合肥、南昌、武汉、长沙、衡阳）为全国的1/3。
（4）高速交通网的发展。发展高速交通是实现交通现代化的重要任务之一。高速交通系统由高速公路、高速铁路、航空运输和海上快艇航运组成，并以现代通信手段为指挥调度手段。
本区以上海、武汉为中心的航空网已初步形成。1988年建成第一条高速公路—沪嘉线。此后又建成沪宁高速公路。各省在省会附近都先后修建高速公路。我国第一条高速铁路京沪线已进行了可行性研究论证，将先建沪宁试验段。海上高速快艇运输已在上海至舟山、宁波间开展业务。高速交通线路的迅速发展将进一步促进经济繁荣。