我国面积辽阔，自然条件复杂，生物种类繁多，生态系统类型丰富。这是大自然赋予我们的宝贵财富。但过去由于我国在长期开发利用自然资源的过程中不够重视自然资源和环境的保护，而造成了严重的破坏，有不少生物种消失或灭绝。为避免自然资源和环境遭到进一步破坏，使之不但有利于当前，而且造福子孙万代，１９８４年３月国务院正式批准阿尔金山自然保护区列为国家级自然保护区。因保护区地处阿尔金山，故名。
阿尔金山自然保护区是我国最大的自然保护区。地理它位于我国青藏高原北麓新疆东南的若羌县境内，与青海、西藏两省区交界。面积约４５０００平方公里，是我国第一个具有完整原始高原生态系统的自然保护区。这里平均海拔高度达４５００米，四周高山耸立，有１００多座５０００米以上的高峰，西南部的慕士塔峰和东南部的新青峰高达７０００余米，形成一个封闭型的高原盆地。山峰附近冰川雄伟，瑰丽多姿、盆地内古岩溶地貌，冰缘地貌广布，其岩溶套叠冰川地貌和数量众多的第四纪大山群均为国内罕见。
阿尔金山自然保护区内分布着世界上海拔最高的沙漠，绵延百里的高寒草原，众多的河流，大面积的荒漠，沼泽湿地，星罗棋布的高山湖泊，冰泉群聚。过去因地理位置偏僻，交通不便，人迹稀少，加上高寒缺氧，气候恶劣，长期以来不为外人所知，使这个典型的高原生态体系和生物群落得以保留。１９８４年新疆维吾尔自治区专门组织了综合考察队对保护区进行了周密的考察，终于揭开了这一地区的神秘。据初步了解，这里的高等植物约有 ２７科９６属２４１种，其中帕米尔报春花、天山毛莨、芪状棘豆等是这里最典型的植物。鸟类约有１１目１８科３２种（包括五种）；啮齿类约有２目６科１３种；一类保护动物有野牦牛、藏野驴、藏羚、盘羊、雪豹、棕熊、赤孤、黑颈鹤、长嘴百灵、蒙古沙鸥等，以珍贵稀有的高原古蹄类动物占优势，属国家保护区的珍稀动物达１６种之多，是国内少见的高原动物园。当你看到数以万计的野牦牛、藏野驴、藏羚成群结队的在旷野奔驰和各种佳鸟飞翔争鸣时，会使你心旷神怡，流连忘返。这种数量之多，密度之大，在国内少有，就是在世界上也属罕见。
阿尔金山自然保护区的建立，对保护该地区完整的原始生态系统和美好的自然环境，保护稀有的高原古蹄类动物资源，拯救濒危物种起了巨大作用，同时也为我国自然科学研究，特别是高原生态生物学的科学研究提供了良好的基地。