在日本使用GIS进行地理教学出现在90年代的后半期。然而GIS在地理教育中的应用并不广泛，是因为很少有教师对GIS可以熟练掌握以及软件的价格昂贵。虽然有的地理课堂上用到了GIS，但是事实上这些课堂的主要目的是教会大家GIS。然而教授GIS的目的却是很模糊的。
在日本地理教育的目的和大多数学校一样，是作为一个观察者，从两个方面来理解世界。然而人们很少考虑在地理课堂上如何展示世界的变化。在地理教育中，理解变化的自然和如何学会在变化的世界中生存非常重要。因此，日本的地理教育开始关注价值的判断和决策的制定。这些都是在生存中应对变化的世界所必须的。
在新西兰，Thomas和Arthur认为GIS在学校对于教授解决问题和进行决策等内容很有用。在日本，尽管GIS很少在课堂中用到，它还是通常作为展示材料使用，而不是作为进行决策的手段使用的。总之，日本学校的地理不能促进学生解决问题和制定决策能力的提高。
日本地理课堂培养了学生的公民权利意识。GIS可以帮助学生提高自己的公民权利意识。此外，学生学习如何收集相关的领域的资料，在学习GIS的同时也很重要。